Режиссер Джеймс Мэнголд раскрыл подробности альтернативного финала, в котором злодей Мадс мог попасть в 1939 год
В финале проекта Воллер отправляется на самолете в прошлое. Из-за ошибки злодея вместе с Индианой и Хеленой они оказываются в 212 году до нашей эры. В итоге самолет разбился вместе с Воллером, а Индиана и Хелена смогли спастись, вовремя выпрыгнув из самолета. Однако, есть и альтернативная концовка, в котором самолет все же прибыл в 1939 год:
«Я бы никогда не сделал этот выбор [утвердил финальную версию концовки], не обдумав множество других вариантов. Я думал об одной идее, в которой мы отправляемся в путешествие во времени, теория Мадса оказывается верной, и они приземляются в нацистской Германии. И в последнем акте фильма Инди попытался бы сорвать план Мадса. Но чем больше я обрисовывал это в уме, тем сильнее все напоминало шпионский фильм. Я не мог найти путь к эмоциональному резонансу».
Однако, решили оставить действующую концовку, так как для Индианы попадание в такое далекое время означало мощный эмоциональный момент.